結局録音時に-ssオプションを付ける事で以前と同じ動作になりました
・ -ss 40 オプションで先頭40秒をカット（余裕を見て40秒にしました）
・但しこのままだとお尻が微妙に切れるので録音時間に5秒足しています。
結果以下の通りです
DURATION=`expr $1 \* 60 + 5`
ffmpeg -loglevel quiet -y -ss 40 -t ${DURATION} -i ${aspx} -acodec libmp3lame -ab 48k -ar 44100 "${savedir}${filename}.mp3"
ズレの根本原因が解かっていないので対処療法なので
又何時破綻するか解かりませんが。